تمتلك جامعة الأزهر ما يقرب من 40 مركزا ووحدة بحثية مزودة بأحدث الأجهزة العلمية التى يمكن من خلالها أن تقوم بالبحث العلمى وخدمة المجتمع على الوجه الأكمل، حيث تمتلك 9 مراكز لخدمة المجال الطبى تقدم خدماتها للجمهور بأسعار مخفضة داخل أروقة جامعة الأزهر والملحقات التابعة لها وذلك على النحو التالى:-
1- المركز الدولى الإسلامى للدراسات والبحوث السكانية.
2-وحدة علاج القصور الكلوي وزرع الكلي.
3-المركز الاسلامي لأمراض القلب وجراحاته.
4- مركز المناعة وأمراض الحساسية.
5- مركز معوقات الطفولة
6- مركز الطب النفسي للمرأة والطفل.
7- وحدة حديثى الولادة – الأطفال المبتسرين.
8- وحدة تفتيت الحصوة لقسم جراحة المسالك البولية.
9-وحدة العلاج بأجر لطب الأسنان.